收集2012年6月至2013年9月天津市第一中心医院血液科就诊的25例itp患者及同期20名健康体检者血浆,采用mirna芯片检测血浆中mirna表达谱,筛选itp血浆差异表达的mirna
近日,研究人员发表论文,旨在筛选免疫性血小板减少症( itp)患者血浆差异表达微小rna( mirna)研究指出, mirna芯片初步筛选出itp患者血浆mirna差异表达谱,生物信息学分析提示钙离子信号通路和t细胞受体信号通路可能与itp患者发病和进展有关该文发表在《中华医学杂志》2014年第13期上通过靶基因预测程序targetscan和miranda进行潜在的靶基因预测,并进行基因本体和信号通路注释分析,探索可能与itp发病相关的基因和信号通路,并用溶血性贫血食补实时( real-time) pcr对差异表达的mirna进行验证
根据基因芯片结果,发现itp患者血浆中存在29个差异表达的mirna,其中上调15个,下调14个,通过靶基因预测程序targetscan和miranda预测出608个潜在的靶基因,基因本体分析显示参与生物学过程的基因占78.12%(475/608);参与分子功能的基因占80.76%(491/608);参与细胞组分的基因占87.66%(533/608),富集分析显示p<0.05的基因本体有9个通路分析显示157个信号通路与608个靶基因相关,富集分析p<0.05的信号通路有25个其中值得特别关注的信号通路是钙离子信号通路和 t 细胞受体信号通路 real-time pcr 显示 itp 患者血浆中mirna4778-5p、mirna4800-5p 显著高于健康对照,而 mirna4707-溶血性贫血怎么检查5p、mirna4721、mirna3620-3p、mirna378i显著低于健康对照(均p<0.05),与芯片结果一致
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